灯鱼疾病，最常见的是白点虫所引起的白点病了，白点是一种寄生虫，会由体表钻入表皮层，到达真皮层时开始吸食鱼身上的营养，使鱼营养不良患病。
​白点病通常出现在换季时温度不稳，或是换水时造成的水温急剧变化后，造成鱼体的抵抗力降低，使病原体多子小瓜虫有机会入侵，病状初期鱼体胸、背、尾鳍及体表能看见白色的胞囊。严重时白点遍布全身。病程５－１０天发现时已较严重２－３天死亡。
白点病首先应该要迅速隔离，然后使用专门针对白点的药物，白点净进行治疗。当水温１５度以下使用白点净０．１５ppm，水温１５度以上使用0.1ppm。
​除了药物治疗，还可以使用加温办法，来治疗白点病，由于小瓜虫只能生存于１０－２５摄氏度的温度环境中，此时小瓜虫的发育周期为１０天，水温高于此温度时小瓜虫会加快发育５天就会完成发育在未及繁殖时死亡。
​所以我们在发现白点病时只需将水温升至２８摄氏度左右，小瓜虫就会因为自动完成发育而死亡。连续保持几天就可以根治白点病。
灯科鱼有时还会得一种霓虹灯病，这是在小型脂鲤科特有的疾病，霓虹灯病是一种可怕的传染病，此病最初发现于霓虹灯，故得名。其他脂鲤科鱼也会有。
症状初期鱼会无规律的游动，离群。随后，开始消瘦，典型症状是背鳍下面肌肉里出现苍白的区域并扩散。
病因主要由孢子虫引起， 孢子由饵料代入鱼体，在鱼体内变成阿米巴型细胞，扩散到整个身体，组成一组组的球型庖囊，肌肉纤维被庖囊逐渐取代，皮肤受损或鱼死亡时，才会把庖囊被释放出来，并有有多次感染症状，多发生在１０－２５摄氏度的温度环境中。
鱼一旦的了霓虹灯病很难根除，不过目前较为有效做法是，使用新型抗寄生虫处理剂和以有机银化合物处理剂混合使用，在用泥炭处理水并使用硅藻过滤器做强有力的过滤.
有的是用甲机蓝来去除细菌，不过翻了书看到的资料是叫做脂鲤微孢子虫(Plistophora hyphessobryconis)的体内虫寄生于肌肉中，造成肌肉坏死、溶解，感染的部分若成了外伤，也会被细菌所附著，最后死亡。所以要治疗应该朝向驱虫的方式下药，然后使用黄药避免感染的部分遭细菌侵蚀。
还有一种办法就是把患病灯科鱼转移走，然后拆卸下水族箱的附属物，对水族箱进行彻底消毒，这也是一个有效的办法。
除此之外，如果是新买进的鱼，新换的水环境也可能造成鱼生病，新买的鱼，它们还没适应运输环境又被带到新家水环境中，这样的鱼很容易“受伤”，如果家中老水亚硝酸盐浓度过高时，鱼就会容易死亡很刚买到家灯鱼，最好开始先少量为食,尽量不要让饲料沉到下面。