鼠鱼分为Aspidoras（拟甲鲶属，简称A属）、Brochis（弓背鲶属，简称B属）及Corydoras（甲鲶属，简称C属）。  
其中最为常见的鼠鱼就是甲鲶属Genus Corydoras，也就是我们一般所谓的C属的鼠鱼，例如豹鼠这类的就是；而弓背鼠类的指的不是印第安鼠，而是青铜鼠、巨无霸鼠这类的鼠鱼，最大的不同点在于背鳍的棘条有11-17条（不同于拟甲鲶属与拟甲鲶属的7条）。而常见的C属的鼠鱼又因为眼睛的位置、头骨的形状、胸鳍的硬棘形态、头长和躯体长度的比例、斑纹的分布，这五点分成几个族群如下：

C属族群鼠鱼包括  
（1).斑甲鲶群（Punctatus Group），代表品种：红帆鼠、米老鼠、宝贝鼠、飞凤鼠、海盗鼠、芝麻鼠、白豹鼠、国王豹鼠、三线豹鼠、茱莉豹鼠、黑翅豹鼠、黑点豹鼠、黑豆豹鼠、紫罗兰鼠、蝙蝠侠鼠、阿格西鼠、大花网鼠、金珍珠鼠等。
  (2).须甲鲶群（Barbatus Group），代表品种：花鼠、蓝鼠、太空飞鼠、青蜂侠鼠等。
  (3).橄榄甲鲶群（Aeneus Group），代表品种：XO鼠、咖啡鼠、熊猫鼠、红头鼠、英哥鼠、斑背鼠、红斜纹鼠、红黑带鼠、奥伯根鼠、新红斜纹鼠、大型红头鼠、长吻红头鼠、金翅帝王鼠、甜甜鼠（娃娃鼠）、印第安鼠（弓箭鼠）、弓背鼠（面具鼠）等。
  (4).丽甲鲶群（Elegans Group），代表品种：绅士鼠、月光鼠、蓝月鼠、精灵鼠、金点鼠、黑腰鼠（瓜波鼠）等。
  (5).尖吻甲鲶群（Actus Group），代表品种：红鳞鼠、帝王鼠、黑箭鼠、长腰鼠、黑影鼠（旗舰鼠）、灰甲鼠（布罗克鼠）、白狐狸鼠、佛利律鼠等。