常说的水质，一缸好水，什么样才算好水好水质，其实好在有自然平衡的微生态体系。

细菌首先分为自营性细菌和异营性细菌自营性细菌是指依靠自身分解无机物来获取能量并且繁殖的细菌，依靠自身来提供能量是命名的来源，虾缸内最最重要的硝化系统的作用菌“硝化细菌“就属于 自营菌，他将其他细菌分解有机物产生的毒害废物氧化分解为无毒的成分。如将氨类分解为亚硝酸盐，再将亚硝酸盐分解为硝酸盐类（分别由两种菌来完成，亚硝酸菌和硝酸菌 ，所以硝化菌其实是 对这两种菌的统称）。硝酸盐可以被植物直接吸收来成为水草的肥料，（水草并不以有机物为他们的肥料）。硝酸盐的毒性可以忽略不计，但是长期积累，会导致水体的PH，GH值的变化（酸碱度，硬 度），从而带来其他的变化，我们需要换水来稀释和缓冲，其实在虾缸 内积累的最终废物并不只有硝酸盐，所以只换水不补水还是值得商榷的。
他们的特点是繁殖速度远低于异营性细菌。在虾缸内需要专门提供环境方便他们构成菌落

异营菌
他们依靠分解有机质来获取能量，也就是我们通常说的腐化菌，大自然中的落叶分解，尸体腐烂都是他们的功劳，他们分解有机质并制造无机物，其中包括氨，氮，硫酸盐类等等。在开放的自然生态 中这些元素就很快被稀释缓冲，吸收。但是在水体相对封闭的虾缸内就需要强大的硝化系统来解决问题，
异营性细菌有的特点是繁殖速度非常快在20个小时内，1个异营性细菌可以分裂成1000000000个。他们无孔不入，有机质丰富的地方他们便大量繁殖，其种类也非常巨量，光是大肠杆菌就有150个型。 在有机质缺乏的时候他们就因缺乏食物而快速消退。由于其在自然界中广泛存在，数量种类远远大于自营性菌.
而且在适当的环境下繁殖迅速，所以通常不像硝化细菌那样需要引入我们的虾缸。
同时，细菌还从其他角度分为好氧菌，厌氧菌，喜光菌，避光菌，这都反映了细菌的生存条件。还是用硝化菌为例就属于自营性，好氧，避光菌。所以我们见到的好品牌的过滤器都将滤桶部分做成深 色。而滤材则要求多孔，有足够的空隙使得硝化细菌能够获得水流带来的氧气。异营细菌也分为上述类别，有的好氧有的厌氧，也有喜光和避光的区别，其种类和数量实在太多。就说乳酸菌，它其实 就是一个菌类家族的统称，其有不同得特点和形状，而我们常接触到的是德氏乳酸杆菌，广泛运用于食品工业中，在人类的口腔和肠道厌氧环境下正常存在。他是一种厌氧菌。

虾缸的微生物系统工作原理基本就是1、异营性腐化菌将有机肥物分解为无机物产生无机废物（有毒害）这一步产生的无机物成分决定于我们投入的饲料等成分构成，而不是取决于细菌本身，
自营性细菌将前者产生的 无机废物分解为虾缸能够承受的无机物（有害到无害的转化）
因此一个成功的虾缸生态系统无不注重硝化系统的建立。
（如果有什么异营菌可以不产生有害无机物而直接将有机物分解为无害无机物那么我们就没必要建立硝化系统了）

基本了解了细菌之后来看我们的虾缸环境。
虾缸内由于观赏和种植水草的需要通常是有光源并呈富氧状态，所以我们需要滤桶等避光区给硝化菌营造合适的生存环境。而为种植水草等铺设低沙的低层处于缺养状态，提供了少量的区域给兼氧菌\ 少数厌氧菌生存。

而微生物生态系统的建立通常还要遵守一些自然法则,比如系统复杂性原则:就是说少数几种微生物是不可能建立起稳定的生态系统的,需要多种多样的微生物分工协作,互相制约也互相支持.又比如生态 自适应原则,一个系统内微生物状态不以投入多少或投入什么来决定,而决定于生态环境提供的条件,比如缺乏糖源的虾缸(糖含量少于100ppm)是无法支持酵母,乳酸等直接需要糖源作为能量来源的菌种 呈优势状态.还有过滤内的生物孤岛模型,水族养殖中体现出来的竞争法则等等.