水晶虾是甲壳类节肢动物，外壳是它们的保护层，至关重要。水晶虾不断生长，而壳是不会长大的，所以需要不断的脱壳。
虾苗阶段生长迅速，脱壳频繁，体型越大，脱壳的频率越低。每次脱壳就是一次历劫，脱壳过程中切记不能扰动，否则十分容易造成脱壳失败卡死的情况。
卵巢发育成熟的母虾，脱壳后会释放特殊气味，引起公虾四处飞舞，找寻刚脱壳的母虾进行交配，然后才能顺利抱卵。
影响脱壳的因素有很多，温度、食物、硬度、水质、外部刺激等都有关联。
在适宜的水温范围内，温度越高，水晶虾的新陈代谢越快，脱壳越频繁，长得也越快。然而过高的水温环境下，水晶虾体质较弱，适应性差，容易暴毙，虾体常出现脱色脱白情况。而当水温低于过低，虾的活力降低，生长缓慢，脱壳自然减少。
缸里滋生的微生物与藻类，人工投喂的虾粮，是水晶虾食物的两大来源。尤其对于密度较大的虾缸，合理的喂食尤为重要。若水晶虾营养不足，势必会对脱壳造成影响。脱下来的虾壳无需捞走，它是水晶虾良好的补钙食物。
硬度对于水晶虾脱壳和发色，都有显著且直接的影响。一般来说硬度较低的软水能让虾更快的脱壳生长，同时也可能会导致脱色脱白，甚至过低的硬度会导致水晶虾缺钙而脱壳失败。硬度较高时，虾脱壳频率降低，生长速度减缓，甲壳颜色更加厚实鲜艳，然而过高的硬度可能会引起脱壳困难的情况。一些人会特意调高硬度，减少脱壳，使水晶虾的颜色变深变厚，这个方法常用于红白、蓝金刚、蓝化黑金刚、黑银河等，但是这样养出来的虾换个环境之后，常伴有无法顺利脱壳的现象。
水质对水晶虾的影响是全方面的，若一口虾缸的硝化系统不完善，可能导致氨与亚硝酸盐偏高，若长期不换水，会致使硝酸盐浓度累积过高，引起水晶虾慢性中毒。此时虾的生存都面临极大挑战，脱壳失败就再正常不过了。
换水、惊吓、加入添加剂等这些外部影响，也容易刺激水晶虾的应激脱壳。
正常蜕去的虾壳一般晶莹剔透且完整，通过虾壳可以从侧面粗略的反映水晶虾的状态。
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