主要从5个方面进行辨认。（图一中1为公鱼，2为母鱼；图二中2、3为公鱼，1为母鱼）
1.颜色方面：斑马鱼母鱼本色更深（如图一中2更蓝）
2.条纹方面：公鱼条纹更厚更明显（图二中2、3）
3.体型方面：母鱼更臃肿更大一点（图一中2），公鱼体型纤细呈流畅的流线型。
4.鱼鳍方面：公鱼所有鱼鳍更长，游动的时候感觉更飘逸。
5.脾气方面：一般来说斑马鱼偶尔相互追逐很常见，但一般有几条总是更频繁、看似更富有攻击性的斑马鱼一般是母鱼，因为母鱼在怀孕的时候脾气会更加暴躁而追逐公鱼，但一般来说斑马鱼只追逐不会撕咬攻击。

这些都是我的经验之谈，各位有什么补充或者指正的可以评论补充。